KDV kanunun 17 maddesinin kültür ve eğitim amaçlı istisnalar başlıklı bölümünde:
Genel ve katma bütçeli idarelerin, ilim, fen ve güzel sanatları teşvik amacıyla yapılan teslim ve hizmetler KDV'den istisnadır şeklinde hüküm altına alınmıştır.
Sizin kurumunuz MEB'e bağlı ise, MEB genel bütçeli bir kuruluş olduğu için verilen eğitim hizmetleri KDV'den istisna olması gerekir diye düşünüyorum.
Devlete ait olan kurumunuzda çalışan kişiler memur oldukları için zaten 94 mad. göre stopaj yapılıyordur. Bu nedenle tekrar stopaj yapılmasına gerek yoktur diye düşünüyorum.