2.1.2. İstisna Kazanç Tutarının Tespiti
Serbest Bölgeler Kanununun geçici 3 üncü maddesinin birinci fıkrasının (a) bendinde yer alan istisna, bir kazanç istisnasıdır. Dolayısıyla, mükelleflerin serbest bölgelerdeki faaliyetlerinden elde ettikleri hasılattan bu faaliyetlere ilişkin olarak yapılan giderlerin düşülmesi sonucu bulunacak kazanç, gelir veya kurumlar vergisinden müstesnadır.
İstisna kazancın doğru bir şekilde tespitinin yapılabilmesi açısından, istisna kapsamında olan faaliyetler ile diğer faaliyetlere ilişkin hasılat, maliyet ve gider unsurlarının ayrı ayrı izlenmesi gerekmektedir. Serbest bölgelerde yürütülen ve istisna kapsamına giren faaliyetlerin zararla sonuçlanması halinde; bu zararların, diğer faaliyetlerden elde edilen kazançlardan indirilmesi mümkün bulunmadığı gibi ertesi yıla devredilmesi de mümkün değildir.
OSMAN EROL' Alıntı:Kural olarak vergiden müstesna tutulan faaliyetlerle ilgili zararlar da vergiden düşülemez. 5084 sayılı Kanunla 3218 sayılı kanunun 6. maddesinde yapılan değişiklikle 06.02.2004 tarihinden itibaren serbest bölgelerde elde edilen kazançlar istisna kapsamından çıkarılmıştır. Dolayısıyla bu tarihten sonra ruhsat almış olanlar istisna kapsamında değildirler. Yani kazançları (imalat faaliyetinde bulunanlar hariç) vergiye tabidir. Dolayısıyla zararları da vergiden düşülecektir.
Sonuç olarak, 06.02.2004 tarihinden önce faaliyet ruhsatı alan işletmeler 31.12.2008 tarihine kadar vergiden müstesnadır, dolayısıyla bunların zararları da mahsup konusu olmaz; Bu tarihten sonra ruhsat alan işletmelerin karları da, zararları da yurt içinde faaliyet gösteren şubelerin zararları gibi işlem görecektir.
.........................
2 - Serbest Bölgelerde Gelir ve Kurumlar Vergisi Uygulamaları
2.1. Geçiş Döneminde Gelir ve Kurumlar Vergisi İstisnası
Serbest Bölgeler Kanununun geçici 3 üncü maddesinin birinci fıkrasının (a) bendi uyarınca, 06.02.2004 tarihine kadar (bu tarih dahil) serbest bölgelerde faaliyette bulunmak üzere faaliyet ruhsatı almış mükelleflerin, ruhsatlarında belirtilen süre ile sınırlı olmak üzere bölgelerde gerçekleştirdikleri faaliyetler dolayısıyla elde ettikleri kazançlar gelir veya kurumlar vergisinden müstesnadır.
Faaliyet ruhsatı almak üzere ilgili mercilere başvurmuş olmakla birlikte, 06.02.2004 tarihine kadar henüz faaliyet ruhsatı alamamış mükelleflerin bu istisna hükümlerinden faydalanabilmeleri mümkün değildir.
.........................
2.2. Ücretlerde Gelir Vergisi İstisnası
Serbest Bölgeler Kanununun geçici 3 üncü maddesinin birinci fıkrasının (b) bendi hükmüne göre, 06.02.2004 tarihine kadar (bu tarih dahil) faaliyet ruhsatı almış mükelleflerin serbest bölgelerde istihdam ettikleri personele ödedikleri ücretler, 31.12.2008 tarihine kadar gelir vergisinden müstesnadır.
......
Bölgelerde faaliyet gösteren mükelleflerin 06.02.2004 tarihine kadar alınmış faaliyet ruhsatlarında belirtilen süre;
- 31.12.2008 tarihinden daha önceki bir tarihte sona eriyorsa söz konusu istisna faaliyet ruhsatlarında yer alan sürenin bitiş tarihine kadar,
- 31.12.2008 tarihinden daha sonraki bir tarihte sona eriyorsa söz konusu istisna 31.12.2008 tarihine kadar,
uygulanacaktır.