Mevzuya ne açıdan bakıp yorumladığınızı çözemedim ama eğer net ücret üzerinden anlaşmanız varsa personelin maaşı sene boyunca değişmez.
6.000,00 TL net ücret veriyorsanız sene sonunda kadar 6.000,00 alır ne eksik ne fazla, vergi dilimlerinden oluşan gelir vergisi farkını şirket karşılar. Brüt ücret verildiğinde maaşında kesinti olur.
Anlattığınız durumda personel haklı, sözleşmesi 6.000,00 üzerindense 5.760,00 veremezsiniz.